Scedosporium aurantiacum: First isolation in Argentina from a previously healthy patient after traumatic inoculation / Scedosporium aurantiacum: primer aislamiento en Argentina de un paciente previamente sano después de una inoculación por un traumatismo

Abstract Scedosporium/Lomentospora species are widely distributed in nature. They are gen-erally saprophytes, but can cause opportunistic infections in immunocompromised patients and occasionally in immunocompetent patients that are difficult to treat due to high lev-els of antifungal resistance. The distribution of Scedosporium/Lomentospora species shows regional differences. Scedosporium boydii and Scedosporium apiospermum are the most fre-quently isolated species in our region, whereas Scedosporium aurantiacum is more common in other regions. We describe the first isolation in Argentina of S. aurantiacum in a vitreous humor infection from a previously healthy patient after traumatic injury in her left eye. Due to the suspicion of fungal endophthalmitis, a mycological study of the vitreous humor was performed. The culture allowed the isolation of S. aurantiacum. The patient was treated with voriconazole with favorable clinic evolution.

Resumen Las especies de Scedosporium/Lamentospora se encuentran ampliamente distribuidas en la naturaleza. En general son saprofitas, pero pueden causar infecciones oportunistas de difícil tratamiento debido a sus altos niveles de resistencia a los antifúngicos en individuos inmunocomprometidos y, ocasionalmente, en personas inmunocompetentes. La distribución de las especies de Scedosporium/Lamentospora muestra diferencias regionales. Scedosporium boydii y S. apiospermum son las especies más frecuentemente aisladas en nuestra región, mientras que en otras S. aurantiacum es más común. Presentamos el primer aislamiento en Argentina de S. aurantiacum de una infección de humor vítreo de un paciente previamente sano que sufrió una lesión traumática. El paciente fue tratado con voriconazol y tuvo una evolución clínica favorable.

Utilidad del panel Sensititre YeastOne® para detectar especies de Candida resistentes a los antifúngicos / Usefulness of the Sensititre YeastOne® panel to detect Candida species resistant to antifungal drugs

Resumen Evaluamos las concordancias interlaboratorio, esencial y categórica entre el panel Sensititre YeastOne™ y los métodos de referencia correspondientes al M27 4.a ed. (Clinical and Laboratory Standards Institute [CLSI]) y al EDef 7.3.1 (European Committee on Antifungal Susceptibility Testing [EUCAST]). Estudiamos 67 cepas de Candida de distintas muestras clí nicas y un panel de 9 cepas resistentes a fluconazol y equinocandinas. El mayor porcentaje de concordancia interlaboratorio se observó con anfotericina B (96,8%) y el menor porcen taje con voriconazol (77,2%). La caspofungina mostró un 5,8% de discrepancias muy mayores con el método de referencia del CLSI. Con el del EUCAST, el itraconazol, el posaconazol y la anidulafungina mostraron porcentajes de discrepancias mayores: el 17,6, el 18,1 y el 19,6%, respectivamente. El panel Sensititre YeastOne™ es una alternativa confiable y fácil de usar, que permite detectar especies de Candida resistentes a los antifúngicos, con algunas limitaciones para las equinocandinas. Los resultados son equiparables a los de los métodos de referencia.

Abstract We evaluated the interlaboratory agreement, the essential agreement, and the cate- gorical agreement between the Sensititre YeastOne™ panel and the reference methods M27 4th Edition of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), and the EDef 7.3.1 of the Euro- pean Committee on Antifungal Susceptibility Testing (EUCAST). We studied 67 Candida strains isolated from different clinical samples and 9 Candida strains with resistance to fluconazole and echinocandins. The highest percentage of interlaboratory agreement was observed with amp- hotericin B (96.8%), and the lowest percentage with voriconazole (77.2%). Caspofungin showed 5.8% of very major errors when compared with the CLSI reference method. For EUCAST, itraconazole, posaconazole, and anidulafungin showed high percentages of major errors: 17.6%, 18.1%, and 19.6%, respectively. Sensititre YeastOne™ is a reliable alternative, and easy to perform for detecting Candida species resistant to antifungal drugs, with some limitations for echinocandins. Results are comparable to those of the reference methods.

Equine rhinosporidiosis in Buenos Aires, Argentina

Abstract Rhinosporidiosis is caused by Rhinosporidium seeberi, a parasitic organism of the family Rhinosporideacea family, class Micomycetozoa. The disease is endemic in India; however, some cases were reported in Europe, Africa, North America, and South America. The aim of the present study is to report three cases of rhinosporidiosis in wild horses in different cities of Buenos Aires province, Argentina. We confirm the presence of R. seeberi in the analyzed samples using histopathological and PCR sequencing techniques.

Resumen La rinosporidiosis es una enfermedad causada por Rhinosporidium seeberi, un organismo parasitario clasificado en la familia Rhinosporideacea, clase Micomycetozoa. Es una enfermedad endémica de la India, pero se notificaron algunos casos en Europa, África, América del Norte y América del Sur. El objetivo del presente estudio fue describir tres casos de rinosporidiosis en caballos de vida libre en diferentes ciudades de la provincia de Buenos Ares, Argentina. Confirmamos la presencia de R. seeberi en las muestras analizadas utilizando técnicas histopatológicas, PCR y secuenciación.

Effectiveness of the National Quality Control Program in Mycology of Argentina and performance evaluation of participating laboratorios / Efectividad del Programa Nacional de Control de Calidad en Micología de Argentina y evaluación del desempeño de los laboratorios participantes

Abstract The National Quality Control Program in Mycology (PNCCM) of Argentina was establishedin 1996 to improve the quality of the mycological diagnosis, to help establish and to setup standardized procedures and continuous training of laboratory staff. The aim of this studywas to assess the effectiveness of the PNCCM in the 1996---2018 period. Data from the NationalMycology Laboratory Network (NMLN) and PNCCM database was used to estimate the increasein the number of controlled laboratories and jurisdictions, the percentage of participation, theimprovement in the quality of results and the adherence to the program. Satisfaction surveyswere performed to assess user satisfaction. The number of controlled laboratories increasedfrom 29 to 146; participation increased from 49% to 93% and general adherence was 72% inthe evaluated period (1996---2018). Improvement in the quality of the results was 15% for lowcomplexity samples; 7% for intermediate complexity samples and 14% for the identification ofhigh complexity strains. Up to 84% of the users consider the PNCCM to be ''very good'' and 16%''satisfactory''. These results show the importance of the PNCCM, which is widely accepted bymycological diagnostic laboratories from Argentina.

Resumen En 1996 se creó el Programa Nacional de Control de Calidad en Micología (PNCCM)de Argentina con el objetivo de mejorar la calidad del diagnóstico micológico, colaborar enel establecimiento de procedimientos estandarizados en aquellos laboratorios que carecen deellos y contribuir a la capacitación continua del personal.El objetivo de este estudio fue evaluar la efectividad del PNCCM en el período 1996-2018.Se utilizaron los datos de la base de la Red Nacional de Laboratorios de Micología (RNLM) ydel PNCCM para estimar el aumento en el número de laboratorios controlados y el porcentajede participación, la mejora de la calidad de los resultados y la adhesión al programa. Paraevaluar el grado de satisfacción de los usuarios, se analizaron las encuestas de satisfacción delos participantes. En el período evaluado, el número de laboratorios controlados aumentó de 29a 146, la participación aumentó de 49% a 93% y la adherencia general de los participantes fue del72%. La mejora de la calidad de los resultados de los laboratorios fue del 15% para muestras debaja complejidad, 7% para muestras de complejidad intermedia y 14% para la identificación decepas de alta complejidad. El 84% de los usuarios considera que el PNCCM es muy bueno y el 16%que es satisfactorio. Estos resultados evidencian la importancia del PNCCM, que es ampliamenteaceptado por los laboratorios que realizan diagnóstico micológico en nuestro país.

Feohifomicosis por Exserohilum rostratum en un paciente pediátrico con leucemia linfoblástica aguda postransplante de médula ósea / Phaeohyphomycosis by Exserohilum rostratum in a pediatric patient with acute lymphoblastic leukemia after bone marrow transplantation

Resumen El género Exserohilum corresponde a hongos dematiáceos, la mayoría fitopatógenos, saprobios, de los cuales solo tres especies serían patógenas para el hombre: Exserohilum rostratum, Exserohilum longirostratum y Exserohilum mcginnisii. Se han reportado infecciones localizadas y sistémicas causadas por estos agentes, tanto en pacientes inmunocompetentes como inmunosuprimidos. Se presenta un caso de infección cutánea por E. rostratum en un paciente pediátrico con inmunocompromiso.

Abstract The genus Exserohilum consists of dematiaceous or darkly pigmented fungi. Most of the species included in this genus are phytopathogens, saprobes and only three of these species would be pathogenic to humans: Exserohilum rostratum, Exserohilum longirostratum and Exserohilum mcginnisii. Localized and systemic infections have been reported both in immunocompetent and immunosuppressed patients. A clinical case of cutaneous infection by E. rostratum in an immunocompromised pediatric patient is presented in this study.

First case report of cryptococcosis due to Cryptococcus decagattii in a pediatric patient in Argentina

Abstract We report the first case of cryptococcosis due to Cryptococcus decagattii in an immunocompetent pediatric patient from an indigenous community in Argentina with a successful outcome. Two isolates (blood, cerebrospinal fluid) were genotyped by restriction fragment length polymorphism of the orotidine monophosphate pyrophosphorylase (URA5) gene as VGIV and identified by multi-locus sequence typing as C. decagattii. Matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry identification indicated genotype VGIII. The minimum inhibitory concentration of amphotericin B, fluconazole, itraconazole, and voriconazole was determined (cerebrospinal fluid: 0.25, 16, 0.12, and 0.12, blood: 0.25, 4, 0.12, and 0.06, respectively, all in mg/L).

Epidemiología de la candidemia y sensibilidad in vitro frente a azoles, anfotericina B y caspofungina en una institución de salud de Valledupar, Colombia / Epidemiology of candidemia and in vitro susceptibility to azoles, amphotericin B and caspofungin in a health institution of Valledupar, Colombia

Introducción: la candidemia es una enfermedad grave, con elevada morbi-mortalidad y cuyo tratamientono siempre conduce a la cura. La distribución de especies de Candida y la sensibilidad antifúngica varía según el área geográfica, incluso entre centros de salud de una misma región. Objetivo:establecer la distribución de especies de Candida y su sensibilidad in vitro frente a diferentes antifúngicos. Materiales y métodos: se realizó un estudio descriptivo, prospectivo y transversal entre noviembre de 2013 y mayo de 2014 de casos de candidemias en una institución de salud de Valledupar,Colombia. Las Concentraciones Inhibitorias Mínimas (CIM) se determinaron según el protocolo estándar M27-A3-S4. Resultados: Se estudiaron 40 aislados clínicos de Candida spp. obtenidos de sangre (97,5%) y médula ósea (2,5%). Del total, 15 (37,5%) fueron caracterizados como Candida tropicalis, 13 (32,5%) del Complejo Candida albicans, cinco (12,5%) del Complejo Candida glabrata, tres (7,5%) como Candida guilliermondii, tres (7,5%) del Complejo Candida parapsilosis y uno (2,5%) como Candida krusei. No se observó resistencia a la anfotericina B ni al voriconazol en ninguno de los aislados, pero sí al fluconazol en uno (6,6%) de Candida tropicalis y uno (33,3%) del Complejo Candida parapsilosis y a la caspofungina en el aislado de Candida krusei y en uno (20%) del Complejo Candida glabrata...

Introduction: candidemia is a serious disease with high morbidity and mortality whose treatment does not always lead to a cure. Candida species distribution and antifungal susceptibility varies by geographic area, even in health centers in a given region. Objective: To establish Candida species distributionand in vitro susceptibility to different antifungal agents. Material and methods: A descriptive, prospective, and cross-sectional study of candidemia cases was performed at a health institution in Valledupar, Colombia between November 2013 and May 2014. The Minimum Inhibitory Concentrations(MIC) were determined following the M27-A3-S4 standard protocol. Results: 40 isolates of Candida spp. obtained from blood (97.5%) and bone marrow (2.5%) were analyzed. Candida tropicalis, 15 (37.5%), Candida albicans Complex, 13 (32.5%), Candida glabrata Complex, five (12.5%), Candida guilliermondii, three (7.5%), Candida parapsilosis Complex 3 (7.5%) and Candida krusei, one (2.5%) were isolated. No resistance of isolates to amphotericin B and voriconazole was observed; in contrast, one (6.6%) isolate of Candida tropicalis and one (33.3%) of Candida parapsilosisComplex showed resistance to fluconazole and a single isolate of Candida krusei and one (20%) of Candida glabrata Complex to caspofungin...

Onicólisis exudativa y paroniquia bacteriana aguda en relación con BIBF-1120 y paclitaxel: respuesta a la terapia tópica / Exudative onycholysis and acute bacterial paronychia related to BIBF-1120 and paclitaxel: response to topical therapy

Se presenta el caso de una paciente de 50 años de edad con cáncer de mama tratada con paclitaxel y BIBF 1120 semanal. La paciente desarrolló al final del duodécimo ciclo de quimioterapia una onicólisis distal, con exudado seroso intenso en el hiponiquio, dolor y mal olor en todas las uñas de las manos. Se trató con ácido fusídico tópico y aceponato de metilprednisolona al 1% dos veces al día, con una excelente respuesta desde los tres primeros días de tratamiento. A la semana de iniciar la terapia tópica, se observó una paroniquia bacteriana con la pérdida de la uña del quinto dedo de la mano izquierda, con cultivos positivos para Staphylococcus aureus sensible a meticilina. Hay pocos casos publicados de onicólisis exudativa asociada a quimioterapia. Sin embargo, están especialmente relacionados con paclitaxel. No se observaron recurrencias de las alteraciones ungueales semanas después de culminar la quimioterapia. Los corticoides tópicos y el ácido fusídico podrían ser considerados como una opción terapéutica cuando la onicólisis exudativa relacionada con paclitaxel esté establecida.

A case of a 50 years-old breast cancer patient treated with weekly paclitaxel and BIBF 1120 is reported herein. At the end of the twelfth cycle of chemotherapy, the patient developed distal onycholysis with intense hyponychium serous exudates, pain and malodor in all her fingernails. It was treated with topical fusidic acid and 1% methylprednisolone aceponate two times daily, with an excellent clinical response from the first three days of treatment. Bacterial paronychia with nail plate loss of the fifth left fingernail was observed a week after the topical therapy was started, with positive cultures for Methicillin susceptible Staphylococcus aureus. There are few reported cases of exudative onycholysis associated with chemotherapy. However, these are especially related to paclitaxel. No recurrences of nail disturbances were observed weeks after the end of chemotherapy. Topical corticosteroids and fusidic acid could be considered as a therapeutic option when exudative onycholysis related to paclitaxel is established.

Primer caso de fungemia por una levadura relacionada con Candida pseudorugosa / First case of fungemia from a yeast related with Candida pseudorugosa

Se presenta el primer caso de fungemia por una especie de Candida relacionada con Candida pseudorugosa. La identificación de las especies de levaduras es de importancia a nivel epidemiológico y para el tratamiento de los pacientes que cursan una infección por levaduras.

Species distribution and susceptibility profile of yeasts isolated from blood cultures: results of a multicenter active laboratory-based surveillance study in Argentina

The Mycology Department of the Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas "Dr. C. Malbrán", conducted the Second National Multicenter Survey on Fungemia due to Yeasts in Argentina. The aim was to obtain updated data of the frequency of the causative species encountered and their in vitro susceptibility to seven antifungal agents. Yeast species were identified by micromorphological and biochemical studies. Antifungal susceptibility testing was performed by the reference microdilution method E.Def 7.1 of the European Committee on Antibiotic Susceptibility Testing (EUCAST). A total of 461 viable yeasts were identified. The most frequent species were: Candida albicans (38.4 %), Candida parapsilosis (26 %), Candida tropicalis (15.4 %) and Candida glabrata (4.3 %). Other uncommon species, such as Candida viswanathii (0.6 %), Candida haemulonii (0.4 %), Candida inconspicua (0.2 %) and Candida fermentati (0.2 %) were also isolated. Among the Candida spp., 5.4 % and 1.6 % were resistant to fluconazole and voriconazole, respectively. Itraconazole and caspofungin were the most efficient agents against all Candida spp. tested (MIC < 1 mg/l). For anidulafungin, 21.6 % of C. parapsilosis showed a MIC value of 4 mg/l. Fluconazole was less active against 53.1 % of Cryptococcus neoformans (MIC > 8 mg/l), 75 % of Trichosporon spp., and 100 % of Rhodotorula spp., Geotrichum candidum, Saccharomyces cerevisiae. The global percentage of mortality was 20 %. The presence of uncommon species reinforces the need for performing continuous laboratory surveillance in order to monitor possible changes, not only in the epidemiological distribution of species, but also in the resistance to antifungal drugs.

Distribución de especies y perfil de sensibilidad de levaduras aisladas de hemocultivos: resultados de un estudio multicéntrico de vigilancia de laboratorio en Argentina. El Departamento Micología del Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas "Dr. Carlos G. Malbrán" condujo el segundo estudio multicéntrico nacional sobre funge- mias debidas a levaduras. El objetivo fue obtener datos actualizados sobre la distribución de especies y la sensibilidad in vitro frente a siete antifúngicos. Las levaduras fueron identificadas mediante el estudio de la micromorfología y la realización de pruebas bioquímicas. La determinación de la sensibilidad se realizó según el método de referencia E.Def 7.1 del European Committee on Antibiotic Susceptibility Testing (EUCAST). Se identificaron 461 levaduras. Las especies más frecuentes fueron Candida albicans (38,4 %), Candida parapsilosis (26 %), Candida tropicalis (15,4 %) y Candida glabrata (4,3 %). Se aislaron otras especies menos comunes, como Candida viswanathii (0,6 %), Candida haemulonii (0,4 %), Candida inconspicua (0,2 %) y Candida fermentati (0,2 %). Entre las especies del género Candida, el 5,4 % y el 1,6 % fueron resistentes al fluconazol y al voriconazol, respectivamente. El itraconazol y la caspofungina fueron los antifúngicos más eficaces in vitro frente a las especies de Candida evaluadas (CIM < 1 mg/l). Para la anidulafungina, el 21,6 % de los aislamientos de C. parapsilosis mostraron una CIM de 4 mg/l. El fluconazol fue menos activo para el 53,1 % de los aislamientos de Cryptococcus neoformans (CIM > 8 mg/l), el 75 % de los aislamientos de Trichosporon spp. y el 100 % de los aislamientos de Rhodotorula spp., Geotrichum candidum y Saccharomyces cerevisiae. El porcentaje de mortalidad fue del 20 %. La presencia de especies infrecuentes refuerza la necesidad de realizar la continua vigilancia de laboratorio con el fin de monitorear posibles cambios, no solo en la epidemiología de las especies causantes de fungemia, sino también en la resistencia a los antifúngicos.

Evaluación de tres métodos para la detección de la sensibilidad in vitro de especies de Candida a los antifúngicos / Evaluation of three methods for in vitro detection of antifungal susceptibility of Candida species

Los métodos de referencia E. Def 7.1 y M27-A3, que detectan resistencia in vitro a los antifúngicos, son onerosos y muy laboriosos, por lo que su implementación en los laboratorios hospitalarios es limitada. Existen técnicas comerciales de simple realización, que permitirían obtener resultados comparables a los que se obtienen con los métodos estándares. Los objetivos de esta investigación fueron: a) comparar los resultados de concentración inhibitoria mínima obtenidos según el método de referencia E.Def 7.1 con los obtenidos mediante el empleo del equipo comercial ATB® Fungus 3 en un conjunto de 82 aislamientos clínicos de Candida spp. frente a los siguientes antifúngicos: anfotericina B, 5-fluorocitosina, fluconazol e itraconazol; b) comparar en ese mismo conjunto de aislamientos los resultados del estudio de sensibilidad al fluconazol por difusión en agar empleando tabletas Neo-SensitabsTM o discos Malbrán con los que se obtienen por el método de referencia. La concordancia general entre el método de referencia y el ATB® Fungus 3 fue del 90,2 %, mientras que la concordancia del método de referencia con los métodos por difusión con discos y con tabletas alcanzó el 96,3% y el 92,7 %, respectivamente. El ATB® Fungus 3 fue eficaz para determinar la sensibilidad a la anfotericina B y a la 5-fluorocitosina, pero se observaron discrepancias al evaluar la sensibilidad a los azoles. Los métodos por difusión resultaron útiles para determinar la sensibilidad al fluconazol; sin embargo, observamos 3 discrepancias muy mayores, 1 mayor y 2 menores con el método de difusión con tabletas, mientras que con los discos solo se produjeron 3 discrepancias menores.

Reference methods E.Def 7.1 and M27-A3 detect in vitro resistance; however, they are expensive and very laborious. Thus, their actual use in hospital laboratories is limited. There are commercial techniques available, having easier accessibility and development, which would yield results comparable to those of the reference methods. The objectives of this study were: a) to compare the results of minimal inhibitory concentration of 82 Candida spp. clinic isolates according to reference method E.Def 7.1 and ATB® Fungus 3; b) to compare the results of fluconazole susceptibility testing by disk diffusion in agar with Neo-SensitabsTM tablets and Malbrán disks with those of the reference methods. Minimal inhibitory concentration for amphotericin B, 5-flucytosine, fluconazole and itraconazole was performed according to the E.Def 7.1 and the ATB Fungus 3 methods and diffusion was carried out with fluconazole disks and tablets. General concordance between the reference method and ATB Fungus 3 was 90.2 % and 96.3 and 92.7% for diffusion with disks and tablets. The ATB Fungus 3 method was effective to determine susceptibility against amphotericin B and 5-flucytosine; however, discrepancies were observed with azole drugs. Disk diffusion methods are useful to determine susceptibility to fluconazole; however, 3 very major, 1 major and 2 minor errors were observed with the tablets, whereas only 3 minor errors were observed with the disks.

Population structure and diversity of the pathogenic fungus Aspergillus fumigatus isolated from different sources and geographic origins

Fifty-five clinical and environmental Aspergillus fumigatus isolates from Mexico, Argentina, France and Peru were analyzed to determine their genetic variability, reproductive system and level of differentiation using amplified fragment length polymorphism markers. The level of genetic variability was assessed by measuring the percentage of polymorphic loci, number of effective alleles, expected heterozygocity and by performing an association index test (I A). The degree of genetic differentiation and variation was determined using analysis of molecular variance at three levels. Using the paired genetic distances, a dendrogram was built to detect the genetic relationship among alleles. Finally, a network of haplotypes was constructed to determine the geographic relationship among them. The results indicate that the clinical isolates have greater genetic variability than the environmental isolates. The I A of the clinical and environmental isolates suggests a recombining population structure. The genetic differentiation among isolates and the dendrogram suggest that the groups of isolates are different. The network of haplotypes demonstrates that the majority of the isolates are grouped according to geographic origin.

Red Regional de Laboratorios para la Vigilancia de las Infecciones Fúngicas Invasoras y Susceptibilidad a los Antifúngicos / Regional Laboratory Network for Surveillance of Invasive Fungal Infections and Antifungal Susceptibility in Latin America

This article describes the general objectives of the Regional Laboratory Network for Surveillance of Invasive Fungal Infections and Antifungal Susceptibility in Latin America. Formation of the Network was coordinated by the Essential Medicines, Vaccines, and Health Technologies Unit of the Pan American Health Organization, with the technical and financial support of the National Center for Microbiology of the Carlos III Health Institute (Spain), and the technical support of the Microbiology Department of the Dr. C. Malbrán National Institute on Infectious Diseases (Argentina) and the Microbiology Unit of the Parasitology Service of the Adolfo Lutz Institute (Brazil). The Network's principle objectives are epidemiological surveillance of invasive fungal infections through detection of antifungal resistance and identification of emergent, invasive fungal infections; establishment of norms and common protocols for early diagnosis of mycoses; and strengthening coordination, communications, and transference mechanisms among countries. The Network must be gradually implemented and must include staff training, a systematic process for sharing technology, evaluation of diagnostic techniques, identification of fungal species, and standardized tests for antifungal susceptibility.